La FDA ha notificado a los profesionales sanitarios y a las pacientes acerca del riesgo elevado de malformaciones del tubo neural y otros defectos congénitos de importancia, como malformaciones craneofaciales y cardiovasculares en bebés expuestos al valproato sódico y fármacos afines (ácido valproico, divalproex) durante el embarazo.

Los profesionales deben informar a las pacientes que reciben estas sustancias y tienen alguna probabilidad de tener descendencia acerca de estos riesgos y considerar la posibilidad de administrar otro tipo de medicamento, especialmente si utilizan valproato para tratar migrañas u otras enfermedades sin riesgo vital para la paciente.

Las mujeres que potencialmente podrían tener hijos debe usar valproato sólo si resulta esencial para controlar su preblema médico. Aquellas pacientes que no palenean activamente quedarse embarazada deben usar un metodo contraceptivo eficaz, ya que el riesgo de malformaciones congénitas es particularmente elevado durante el promer trimestre de gestación, especialmente antes de que la mujer sepa que está embarazada.